原因分析：
（1）民办高等教育在快速发展过程中，确实存在一些不容忽视的问题，既有内部的原因，也有外部的原因。
从外部环境看，主要是政府政策不到位、社会环境不利等造成的。具体而言，包括招生问题、师生待遇问题、评估问题和管理问题等。有些地方还存在地方保护主义，排挤外来民办高校的招生。
从内部来看，时下民办高校还普遍存在家族式管理、企业式管理等。但在这些问题中，当务之急要解决资金问题。民办高校以学费收入为主，政府的资助极为有限，举办者的投入和社会捐助很少。
（2）很多地方的教育管理部门，并没有真正把民办高校视为和公立学校平等的教育单位，有意无意中的歧视、排斥甚至打压时常发生，造成了民办高校低人一等的事实，而这一事实又在某种程度上加剧了民间对民办高校的歧视，而这种歧视又让很多本来有志于教育事业的投资人，变成了目光短浅的赚钱者。
对策分析：
（1）教育不同于其他产业，不能按企业的方式来运作，唯有把社会效益置于首位，以学生为本，提高质量才是办学的长远之计，办学动机要逐步端正。
（2）在内部管理上，中宜教育戴老师认为民办高校要积极借鉴古今中外的私立(民办)高校的管理经验，而且不断吸取办学管理实践中所积累的各种经验教训，日趋科学化、规范化和制度化。
（3）通过加强专职教师队伍建设，改善教学环境，更新仪器设备等努力提高质量。戴斌老师认为还应提高老师与职工待遇，包括工资和各种福利。稳定教师队伍，加强师资队伍建设。
（4）完善地方立法，有针对性地解决地方民办高校的难题。
（5）设立专项基金、采取经费资助、为资金信贷提供担保等方式扶持地方高校
（6）尝试进行民办高校有限度的自主招生的试点；享受与公办学校相同的优惠政策；落实与公办学校一视同仁的师生待遇。
（7）针对人才市场需求，允许自主设置和调整专业，提高教育质量，培养“适销对路”专门人才。
